探偵修行に励みながらも、平和な日々を送る空と直。そんな中、いつもぴったり息の合っていた七海と真一朗の様子がおかしい。事あるごとにケンカし、険悪なムードが漂う２人を仲直りさせようとするが、なかなかうまくいかない。学園では、祭の働きかけによりようやく正式な機関として認められた「学園なんでも屋」にそっくりのニセモノが現れ、生徒を混乱に巻き込む事件が続く。ニセモノを探す空だが、逆に罠にはまり、自分と仲間の首に時限装置つきの首輪をはめられてしまう。空は制限時間までに皆を救いだせるのか？そして、ニセモノの正体と共に、隠されていた衝撃的な真相とは…